Perl avancé : Perl Objet et BioPerl

Lieu : IRISA
Dates : du 27 au 29 mars 2012
Intervenant : Fabrice Legeai

Objectifs 

Maîtriser les notions avancées de PERL pour le développement d’applications en bioinformatique.

Pré-requis

Connaissance de Perl ou avoir suivi le module « Introduction à Perl« .

Programme

Rappels de quelques notions indispensables: référence, hachage, modules.
- Notions de programmation orientée objet.
- PERL objet.
- BioPERL.
- Générer et utiliser un modèle objet à partir une bases de données avec Class::DBI.
- Manipuler des données NGS avec samtools et Bio::DB::Sam.

 

Plus d’informations et inscriptions sur le site de la formation continue de Rennes 1

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